Protein–RNA interactions for Protein: P63128

ERVK-9, Endogenous retrovirus group K member 9 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-9P63128 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-9P63128 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms