Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms