Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms