Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms