Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA1P59665 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms