Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BACE1P56817 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BACE1P56817 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BACE1P56817 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BACE1P56817 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BACE1P56817 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BACE1P56817 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BACE1P56817 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BACE1P56817 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BACE1P56817 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BACE1P56817 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BACE1P56817 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BACE1P56817 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BACE1P56817 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BACE1P56817 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BACE1P56817 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BACE1P56817 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BACE1P56817 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BACE1P56817 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BACE1P56817 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BACE1P56817 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BACE1P56817 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BACE1P56817 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BACE1P56817 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BACE1P56817 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BACE1P56817 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BACE1P56817 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BACE1P56817 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BACE1P56817 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BACE1P56817 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BACE1P56817 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BACE1P56817 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BACE1P56817 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BACE1P56817 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BACE1P56817 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BACE1P56817 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BACE1P56817 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BACE1P56817 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BACE1P56817 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BACE1P56817 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BACE1P56817 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BACE1P56817 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BACE1P56817 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BACE1P56817 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BACE1P56817 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BACE1P56817 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BACE1P56817 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BACE1P56817 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BACE1P56817 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BACE1P56817 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BACE1P56817 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BACE1P56817 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BACE1P56817 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BACE1P56817 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BACE1P56817 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BACE1P56817 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms