Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP6P55212 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms