Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLTPP55058 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLTPP55058 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLTPP55058 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLTPP55058 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLTPP55058 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLTPP55058 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLTPP55058 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLTPP55058 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLTPP55058 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLTPP55058 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLTPP55058 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLTPP55058 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLTPP55058 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLTPP55058 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PLTPP55058 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLTPP55058 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLTPP55058 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLTPP55058 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLTPP55058 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLTPP55058 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLTPP55058 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLTPP55058 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLTPP55058 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLTPP55058 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLTPP55058 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PLTPP55058 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLTPP55058 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLTPP55058 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLTPP55058 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLTPP55058 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLTPP55058 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLTPP55058 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 881.6 ms