Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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