Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP153P49790 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP153P49790 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP153P49790 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP153P49790 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP153P49790 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP153P49790 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP153P49790 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP153P49790 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP153P49790 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP153P49790 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP153P49790 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP153P49790 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP153P49790 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP153P49790 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP153P49790 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP153P49790 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP153P49790 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP153P49790 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP153P49790 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP153P49790 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP153P49790 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP153P49790 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP153P49790 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP153P49790 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP153P49790 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP153P49790 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP153P49790 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP153P49790 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP153P49790 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP153P49790 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP153P49790 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP153P49790 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP153P49790 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP153P49790 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP153P49790 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP153P49790 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP153P49790 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP153P49790 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP153P49790 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP153P49790 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP153P49790 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP153P49790 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP153P49790 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP153P49790 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP153P49790 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP153P49790 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP153P49790 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP153P49790 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP153P49790 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP153P49790 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP153P49790 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP153P49790 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP153P49790 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP153P49790 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP153P49790 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP153P49790 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP153P49790 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP153P49790 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP153P49790 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP153P49790 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP153P49790 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP153P49790 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP153P49790 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP153P49790 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP153P49790 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP153P49790 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP153P49790 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP153P49790 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP153P49790 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP153P49790 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP153P49790 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP153P49790 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP153P49790 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP153P49790 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP153P49790 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP153P49790 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP153P49790 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP153P49790 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP153P49790 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP153P49790 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP153P49790 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP153P49790 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP153P49790 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP153P49790 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP153P49790 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP153P49790 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP153P49790 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP153P49790 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP153P49790 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP153P49790 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP153P49790 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP153P49790 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP153P49790 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP153P49790 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP153P49790 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP153P49790 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP153P49790 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP153P49790 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP153P49790 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms