Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLK1P49759 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLK1P49759 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLK1P49759 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLK1P49759 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CLK1P49759 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLK1P49759 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLK1P49759 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLK1P49759 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLK1P49759 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLK1P49759 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLK1P49759 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLK1P49759 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CLK1P49759 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLK1P49759 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLK1P49759 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLK1P49759 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLK1P49759 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLK1P49759 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLK1P49759 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLK1P49759 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLK1P49759 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLK1P49759 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLK1P49759 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms