Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPIAP49247 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPIAP49247 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RPIAP49247 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPIAP49247 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPIAP49247 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPIAP49247 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPIAP49247 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPIAP49247 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPIAP49247 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPIAP49247 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPIAP49247 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPIAP49247 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPIAP49247 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPIAP49247 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPIAP49247 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPIAP49247 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPIAP49247 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPIAP49247 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPIAP49247 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPIAP49247 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPIAP49247 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPIAP49247 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPIAP49247 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPIAP49247 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPIAP49247 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPIAP49247 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPIAP49247 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPIAP49247 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPIAP49247 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPIAP49247 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPIAP49247 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPIAP49247 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms