Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms