Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ME1P48163 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ME1P48163 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ME1P48163 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ME1P48163 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ME1P48163 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ME1P48163 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ME1P48163 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ME1P48163 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ME1P48163 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ME1P48163 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ME1P48163 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ME1P48163 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME1P48163 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME1P48163 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms