Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRXP46100 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRXP46100 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRXP46100 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRXP46100 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRXP46100 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRXP46100 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRXP46100 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRXP46100 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRXP46100 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRXP46100 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRXP46100 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRXP46100 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRXP46100 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRXP46100 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRXP46100 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRXP46100 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRXP46100 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRXP46100 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRXP46100 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRXP46100 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRXP46100 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRXP46100 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRXP46100 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRXP46100 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRXP46100 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRXP46100 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRXP46100 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRXP46100 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRXP46100 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRXP46100 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRXP46100 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRXP46100 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRXP46100 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRXP46100 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRXP46100 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRXP46100 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRXP46100 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRXP46100 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRXP46100 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRXP46100 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRXP46100 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRXP46100 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRXP46100 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms