Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDH1P40925 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDH1P40925 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDH1P40925 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDH1P40925 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDH1P40925 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDH1P40925 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDH1P40925 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDH1P40925 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDH1P40925 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDH1P40925 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDH1P40925 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDH1P40925 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDH1P40925 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDH1P40925 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDH1P40925 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDH1P40925 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDH1P40925 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDH1P40925 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDH1P40925 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDH1P40925 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDH1P40925 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDH1P40925 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDH1P40925 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDH1P40925 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDH1P40925 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDH1P40925 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms