Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNCAP37840 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNCAP37840 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms