Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP62P37198 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP62P37198 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms