Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms