Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms