Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKBRP32239 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms