Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms