Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms