Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A5P29400 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms