Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
DNMT1P26358 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DNMT1P26358 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DNMT1P26358 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNMT1P26358 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DNMT1P26358 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms