Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms