Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms