Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APCP25054 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APCP25054 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APCP25054 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APCP25054 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
APCP25054 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APCP25054 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APCP25054 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APCP25054 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APCP25054 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APCP25054 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APCP25054 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APCP25054 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APCP25054 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APCP25054 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APCP25054 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APCP25054 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APCP25054 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APCP25054 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APCP25054 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APCP25054 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APCP25054 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APCP25054 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APCP25054 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APCP25054 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APCP25054 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APCP25054 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APCP25054 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APCP25054 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APCP25054 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APCP25054 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APCP25054 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APCP25054 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APCP25054 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APCP25054 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APCP25054 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APCP25054 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APCP25054 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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