Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms