Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
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