Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYT1P21579 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYT1P21579 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SYT1P21579 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT1P21579 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT1P21579 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT1P21579 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT1P21579 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT1P21579 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT1P21579 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT1P21579 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT1P21579 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT1P21579 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT1P21579 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT1P21579 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT1P21579 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT1P21579 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT1P21579 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT1P21579 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT1P21579 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT1P21579 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT1P21579 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT1P21579 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT1P21579 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT1P21579 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT1P21579 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms