Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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