Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms