Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HKR1P10072 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HKR1P10072 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HKR1P10072 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HKR1P10072 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HKR1P10072 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HKR1P10072 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HKR1P10072 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms