Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms