Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms