Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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