Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HSP90AB1P08238 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms