Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOP08100 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOP08100 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOP08100 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOP08100 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOP08100 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOP08100 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOP08100 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOP08100 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOP08100 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOP08100 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms