Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFP01375 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFP01375 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFP01375 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFP01375 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFP01375 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFP01375 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFP01375 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFP01375 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFP01375 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFP01375 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFP01375 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFP01375 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFP01375 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms