Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CBX7O95931 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CBX7O95931 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CBX7O95931 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CBX7O95931 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CBX7O95931 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX7O95931 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX7O95931 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms