Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms