Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX6O95475 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX6O95475 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX6O95475 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX6O95475 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX6O95475 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX6O95475 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX6O95475 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX6O95475 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX6O95475 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX6O95475 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX6O95475 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX6O95475 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX6O95475 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX6O95475 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX6O95475 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX6O95475 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX6O95475 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX6O95475 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX6O95475 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX6O95475 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX6O95475 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIX6O95475 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIX6O95475 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIX6O95475 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIX6O95475 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIX6O95475 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIX6O95475 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX6O95475 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX6O95475 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms