Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRMUO75648 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRMUO75648 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRMUO75648 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRMUO75648 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRMUO75648 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRMUO75648 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRMUO75648 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRMUO75648 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRMUO75648 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRMUO75648 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRMUO75648 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRMUO75648 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms