Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP10AO60312 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms