Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms