Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMC8O43402 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMC8O43402 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMC8O43402 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMC8O43402 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMC8O43402 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMC8O43402 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMC8O43402 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMC8O43402 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMC8O43402 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMC8O43402 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMC8O43402 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMC8O43402 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMC8O43402 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMC8O43402 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMC8O43402 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EMC8O43402 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMC8O43402 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMC8O43402 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMC8O43402 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EMC8O43402 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EMC8O43402 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EMC8O43402 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EMC8O43402 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EMC8O43402 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EMC8O43402 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMC8O43402 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMC8O43402 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMC8O43402 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMC8O43402 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms