Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTIFO43310 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTIFO43310 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms