Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms