Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms